Sh_002I17_g000090

Overview
NameSh_002I17_g000090
Unique NameSh_002I17_g000090
Typegene
OrganismR570 Sugarcane cultivar (R570 (sugarcane cultivar))
Sequence length3270
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Structural and functional annotation of S. officinarum2017-07-25
Properties
Property NameValue
NoteConserved hypothetical protein
TypemRNA
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sh_002I17contigSh_002I17:54468..57737
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Sh_002I17_t000090Sh_002I17_t000090R570 Sugarcane cultivarmRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Sh_002I17_g000090 ID=Sh_002I17_g000090|Name=Sh_002I17_g000090|organism=R570 Sugarcane cultivar|type=gene|length=3270bp
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TTTTGAGGAGAGGTCATTTGGTGATATAGTCAAACCTGGTGAAATAACTT
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CTCGCTTTGTTTGATGGTGATTGTGCTACTATACTTTTCAATTTTCCTAA
ATTGCATTTAGTCATCACTTGTCATTTAAATCATGATATTTTCCAGGAGA
TAAGATGCTATTCGCATGCTCAGGCATACCTATACCTCACGGAAGAACTA
GACAAAGCCTAACAAGATTTGTGACATCAGCACATTTGGTTAGACAATTC
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TTGTGTTCCTTGATTTTTCTTTGTATATTCAAGCTAACTGTGAACATCCT
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TGCTATCGTCACATGCTTGGGCTTCCTAGGAGTCCGTCCTATAGATCTGG
ATCATAAGGCAAAACTTTTCCCAGGTGATAGTTTGAAAGCGGCTGGGCGT
GCCTTCAACTCTGGCAGTTTGATGGCCATGCATGGATATCTGTATCAGAA
ACGCCCCCTCGAACACCTCGAACACCTCAACACTTGGGTTTCTGATAGTC
AAGATATCTCTAAGGTATACTGTCAATTTATTTATTTGTGACTTTGTGGC
ATGATGGAAAACATGGAACACATAATTGCGTTATGTCATTGCTGGTCTAA
AGTATCACCGTGTGCATTGAAGCAAATCCTTTCTAAACCTACCACTTTGC
TTTTGTTGTAGGCTGTACTTGGAGGGCCACTTCTGGGGTGCGATAAAACA
ATTCTCGGCATAAACTTAGATATTTATGACCCTGATAATGGAATTTCGAG
ATGCACCTTTCTATCTATGGACTTACTTCGCAAACGCTTGAAGCATTTTT
AGATACTCAAGTATGTCTTCTACACTTACAGTATATATGAACTATTTCTT
CAGTTAACCTGATTCATATTTGTTCCAAACCCTCTCTCCTAATCCACTTC
CTGTTTAAGGTAAGCCATTTTTACTAACAGCATTGGAGACTTAGGAGTTT
TCACATGGTAACCTATGGATTGAAAATAATCTGGTTCTTCTTACCCCTCT
CTATTGAAACCAGTACCATTGCCAGATCTTACGATGCTAACTTAGTGCCC
ATGCTTAATGCTTTGGTCTAAATTAGGAAGAATTAAACAATTCTTTGTGG
CAATGTGTACAATGCAACTTGTATTTGTGACATGAATATGCTGAATCCTC
TCATCTTTTGTTGAATATTTATGCCTGATTCCAAGTCATTATTTCATACC
TTTATTTCTTTCACAAGACAAGATTAGATTCATGTGTTGTTATGATTTGG
TTTTTTTCCCTATGTAGTTCCTGTATTTTATTGCCATAACAAGTCAACTA
TGTTTTATTGCAGTCCTAAAAAACTAGACTTCCGTGGATATACATTGCCT
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GGGTTTATGCAAATTATTTGCAGGTTAAAGTCAAAAGGGTATCCCATTCC
ACCACCACTTGTGCTCGAATGTAAGTGTTGCTTTTGATATTGCTGTCGTC
TCCCTTGTCCCTTTTTGTAGTTCACTTCTGATCTTCTCTGTTTAAATAGT
CAATGGGCGGTTGCTTAATCATTTTGAAGAATGCTTTTGGTGAATTACTT
CCTTGGAAAGGGTTTCCCTATGGTGATCCACCCGGTGGCTCTGGGCAACA
TGTCTGGAATCAACTTCCGAAAGAAGTTGTGACAGATGTATCCCGTCGTG
TCGTCTCACTTGCTTCATTCGATGGTGATTTTTCCAGCTGTGTACTCCTT
ACTTGTCTGTGCCACTAGTATTTTATCTTCACTAACTAATTAATGATTAA
ACTTATAATGTGTAGGGTACGTGAGATCTTTTGCATGCACAGGCTTGCTT
AGAAAGTGGCATGGAAGCAAAGCTAAGCACACTGTCATCCTGACTTCAGC
CAGTTTGGTTAGAGGTCATTGTAAAGAGGATAGCATTGATAATAGCTTGA
CGGTTGGTGCTCCTTAGTCCTTATCATTATTTTTGGTCTTTTAAGTTTAA
TGATGGTTCACTATGCTCACTTTCTCATTGCAGATTGAGGTGTTTCTCCC
ACCGAATCAACGTGCTGGTGGGACATTGGAATTTTATAATTTAGACTATA
ACATTGCTATTGTCAGTCTCAAGAAGAATTTCAGTGCTATTTGTCCGGAC
GACATCTTCGTTGAAAGTGCACAAAACTCATCTAAAAAGATTGTAACTAT
AGGGCGTGATGCTAAATTTGGTATATTAATGGCCGCAAGTGGTGAAGTGA
TGCCAGGAAACAAGAGTTGCGAACTTGATTGCAAAGATGTTCCGCTGTCT
TCTTGTAAAATCAAGAAGGTACTGTGGTGAATCTCTCTTACTATTCTTTT
ATATGGTAACCGGTTTAATCATATTGCATCTACTGAACTTATCAGGAATT
TCAAGTTTTCCAGTAACCTTGGGCCTTTTTTTTAAACTAGGCTGGGATTG
GAGGCCCGCTTATTAATCTTGATGGGAGTTTTGTTGGCATGAACTTCTAC
GATGGAAGCGGTGTAACTCCTTTCTTACCAAGGCACAAGATTGTTAAAGT
TCTAAGTGGAGTGAATTCTTTACCATCAGAATGGTATTATTTTCATCTGA
ATGCTAACTTGTATAGGCATGACACATATTTTACAAACTTTGATTTTTTT
TGTTTGATGACAGTGGATATAACCATCCTATGCCTGTCAATGTTATTGGT
GGGACAAAGAAGGGGATTCAGAAATGCAGGTATTTCTTTCTGTTTTCGCA
TTGCCACTTGTTTCTGTTTGCTTAGACTATTTTATTCACCAGCCAACTTA
CCTTGGAACAAAAACATATTTGATGACAGGTGGCCAGTGCCCGAGCCATA
TTGGTATCATGGCGCACTTGATGCAAGTGTTCATGATCTAGGCAAGCGTA
TTGGGCGGCGTCTTAATTAG
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gene from alignment at Sh_002I17:54468..57737-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Sh_002I17_g000090 ID=Sh_002I17_g000090|Name=Sh_002I17_g000090|organism=R570 Sugarcane cultivar|type=gene|length=3270bp|location=Sequence derived from alignment at Sh_002I17:54468..57737- (R570 Sugarcane cultivar)
ATGCAACGATTCAATGAACCTTTTCATGATAGAGAAGGTTCAAACGTTGC TTTTGAGGAGAGGTCATTTGGTGATATAGTCAAACCTGGTGAAATAACTT ATCCAATCAGTAGTAATTATGCTGTGGATCTGTCTTCCTTGGTCGTCTCA CTCGCTTTGTTTGATGGTGATTGTGCTACTATACTTTTCAATTTTCCTAA ATTGCATTTAGTCATCACTTGTCATTTAAATCATGATATTTTCCAGGAGA TAAGATGCTATTCGCATGCTCAGGCATACCTATACCTCACGGAAGAACTA GACAAAGCCTAACAAGATTTGTGACATCAGCACATTTGGTTAGACAATTC AACGAGAAGAGAAATAAAGATGATAAGTTGAGGGTTGGTGCTACTAATCA TTGTGTTCCTTGATTTTTCTTTGTATATTCAAGCTAACTGTGAACATCCT GAGCTTGTGCTTGTGTATTGCTTTTATTTCTGTAGGTTGTAGTGCGCCTT CCTAATAATACAGCTACTGATGGGTTCTTAGGACTATATGATAAAGACAT TGCTATCGTCACATGCTTGGGCTTCCTAGGAGTCCGTCCTATAGATCTGG ATCATAAGGCAAAACTTTTCCCAGGTGATAGTTTGAAAGCGGCTGGGCGT GCCTTCAACTCTGGCAGTTTGATGGCCATGCATGGATATCTGTATCAGAA ACGCCCCCTCGAACACCTCGAACACCTCAACACTTGGGTTTCTGATAGTC AAGATATCTCTAAGGTATACTGTCAATTTATTTATTTGTGACTTTGTGGC ATGATGGAAAACATGGAACACATAATTGCGTTATGTCATTGCTGGTCTAA AGTATCACCGTGTGCATTGAAGCAAATCCTTTCTAAACCTACCACTTTGC TTTTGTTGTAGGCTGTACTTGGAGGGCCACTTCTGGGGTGCGATAAAACA ATTCTCGGCATAAACTTAGATATTTATGACCCTGATAATGGAATTTCGAG ATGCACCTTTCTATCTATGGACTTACTTCGCAAACGCTTGAAGCATTTTT AGATACTCAAGTATGTCTTCTACACTTACAGTATATATGAACTATTTCTT CAGTTAACCTGATTCATATTTGTTCCAAACCCTCTCTCCTAATCCACTTC CTGTTTAAGGTAAGCCATTTTTACTAACAGCATTGGAGACTTAGGAGTTT TCACATGGTAACCTATGGATTGAAAATAATCTGGTTCTTCTTACCCCTCT CTATTGAAACCAGTACCATTGCCAGATCTTACGATGCTAACTTAGTGCCC ATGCTTAATGCTTTGGTCTAAATTAGGAAGAATTAAACAATTCTTTGTGG CAATGTGTACAATGCAACTTGTATTTGTGACATGAATATGCTGAATCCTC TCATCTTTTGTTGAATATTTATGCCTGATTCCAAGTCATTATTTCATACC TTTATTTCTTTCACAAGACAAGATTAGATTCATGTGTTGTTATGATTTGG TTTTTTTCCCTATGTAGTTCCTGTATTTTATTGCCATAACAAGTCAACTA TGTTTTATTGCAGTCCTAAAAAACTAGACTTCCGTGGATATACATTGCCT AAACATGTATTCAGCATCGTTCCTTCAGGTGTGAACAATACTGCAAGCCA TCTTCTAAAATGTTGCCTATGTATCATTGTGCGCAGAATACTATGTTGCC AGTATCACACATATCATCTGAGGACTAACAGTGATCTCAATATTGCATCA GGGTTTATGCAAATTATTTGCAGGTTAAAGTCAAAAGGGTATCCCATTCC ACCACCACTTGTGCTCGAATGTAAGTGTTGCTTTTGATATTGCTGTCGTC TCCCTTGTCCCTTTTTGTAGTTCACTTCTGATCTTCTCTGTTTAAATAGT CAATGGGCGGTTGCTTAATCATTTTGAAGAATGCTTTTGGTGAATTACTT CCTTGGAAAGGGTTTCCCTATGGTGATCCACCCGGTGGCTCTGGGCAACA TGTCTGGAATCAACTTCCGAAAGAAGTTGTGACAGATGTATCCCGTCGTG TCGTCTCACTTGCTTCATTCGATGGTGATTTTTCCAGCTGTGTACTCCTT ACTTGTCTGTGCCACTAGTATTTTATCTTCACTAACTAATTAATGATTAA ACTTATAATGTGTAGGGTACGTGAGATCTTTTGCATGCACAGGCTTGCTT AGAAAGTGGCATGGAAGCAAAGCTAAGCACACTGTCATCCTGACTTCAGC CAGTTTGGTTAGAGGTCATTGTAAAGAGGATAGCATTGATAATAGCTTGA CGGTTGGTGCTCCTTAGTCCTTATCATTATTTTTGGTCTTTTAAGTTTAA TGATGGTTCACTATGCTCACTTTCTCATTGCAGATTGAGGTGTTTCTCCC ACCGAATCAACGTGCTGGTGGGACATTGGAATTTTATAATTTAGACTATA ACATTGCTATTGTCAGTCTCAAGAAGAATTTCAGTGCTATTTGTCCGGAC GACATCTTCGTTGAAAGTGCACAAAACTCATCTAAAAAGATTGTAACTAT AGGGCGTGATGCTAAATTTGGTATATTAATGGCCGCAAGTGGTGAAGTGA TGCCAGGAAACAAGAGTTGCGAACTTGATTGCAAAGATGTTCCGCTGTCT TCTTGTAAAATCAAGAAGGTACTGTGGTGAATCTCTCTTACTATTCTTTT ATATGGTAACCGGTTTAATCATATTGCATCTACTGAACTTATCAGGAATT TCAAGTTTTCCAGTAACCTTGGGCCTTTTTTTTAAACTAGGCTGGGATTG GAGGCCCGCTTATTAATCTTGATGGGAGTTTTGTTGGCATGAACTTCTAC GATGGAAGCGGTGTAACTCCTTTCTTACCAAGGCACAAGATTGTTAAAGT TCTAAGTGGAGTGAATTCTTTACCATCAGAATGGTATTATTTTCATCTGA ATGCTAACTTGTATAGGCATGACACATATTTTACAAACTTTGATTTTTTT TGTTTGATGACAGTGGATATAACCATCCTATGCCTGTCAATGTTATTGGT GGGACAAAGAAGGGGATTCAGAAATGCAGGTATTTCTTTCTGTTTTCGCA TTGCCACTTGTTTCTGTTTGCTTAGACTATTTTATTCACCAGCCAACTTA CCTTGGAACAAAAACATATTTGATGACAGGTGGCCAGTGCCCGAGCCATA TTGGTATCATGGCGCACTTGATGCAAGTGTTCATGATCTAGGCAAGCGTA TTGGGCGGCGTCTTAATTAG
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