Sh_001B06_g000090

Overview
NameSh_001B06_g000090
Unique NameSh_001B06_g000090
Typegene
OrganismR570 Sugarcane cultivar (R570 (sugarcane cultivar))
Sequence length4246
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sh_001B06contigSh_001B06:85076..89321
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Structural and functional annotation of S. officinarum2017-07-25
Properties
Property NameValue
NoteConserved hypothetical protein
TypemRNA
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
Sh_001B06_t000090Sh_001B06_t000090R570 Sugarcane cultivarmRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene sequence

>Sh_001B06_g000090 ID=Sh_001B06_g000090|Name=Sh_001B06_g000090|organism=R570 Sugarcane cultivar|type=gene|length=4246bp
ATGGCTTCCTCCCCGTGGCCGCGCACCGCCGGTGCCGCCCCCGTCCCGCC
GCCAGAAGCAGCAGCAGCTGCTGCTACTGCCGCCGCCACCCCCGCCCCGA
CGTCGGAGCAGCACCGGGTTAAGGTCCCCCCACAACCCCGTTTTTTATTC
TCTCCCACGGTCGATGGCTCGTTTTCTCTGGCTCTTCAGGTCCAAGCTGA
GCTCCTGACTGGTGCGTGCAGGAGGAAGGAAACGCTGCCGCCGCGGCTGT
ACCGAAGCAGGAGGAGGAGGAGGCCAAGCCCCACTTGCCGCCGGACGATG
ACTCGTAATTGCGATCCCCCTTGCCATGCGTCGCTTCTCTGTTACCGCAA
TGCATGCTCTGTCCTTGCGTGATTCTCGATAGAAACGCTGCTTCACTTAC
GGTTATATTGTTTTATGCGTGCACCCGTAGGACTATATGGGATCCGCGAA
CACGCTGTTGTATACTTGTATAGCCGACGGAGGTAGATGTCTGATACTAG
TGCATGGATGAGATGGGGCTGTTACCCTAATACTGGTTGGCCCGTAGCCC
CGTAACAATGGATAGTATATTAATGTTATTATATACTCATATACGGATAT
ACCAATAACAGGAGTACCTCATCAGTCACCACTTTTGTAGTTTTACCATG
TGCACAAGGAGTGGTGGAGCCAGAACCAAAGCCCTGTCAGCTCAACAGCA
CTGATATTCTGGACTTAATATATTTGTTTGTAAGCAAATTTTAGCAAAAG
AGGTGCTACTTTGCAAAAACCTGTGGGGTCGATGTGGTTCCACTATGGAG
CACATGCGAGTGCCTCTTCATCTTTGACGCGGTGTTAGGCATGCGAAGGG
AACATGATTAGGCTATATGTTGTTGATAATCATGTAAAAATAGTGGCAAA
AAGGAATCAAGTTAGTATATATTTTTTTTCAGAAAGTGCGTCAAGGTATA
CCATTTGCACATCTTATTTCTCCTAATTTTCTGGTTCCAGCATATTAGTT
CTCTCTGGAAGAAGAAGAAAAAGGATGACATCTGTTCTCTACTTAGTGAA
AAACACACATAGGTTTCGTCCCTATACATTGATTCTTTGCATCTGTAATG
TCACATCTTCTATCTTGTAGAGTTTTGGTCTCTCTATCAACAATGTATCC
AAATCCCACGATTGACAAGCTGATCTGGACAATTTTGACTTTGTAGTAAG
TTACACATTGAATTGTTTGACTAATTACCTTTTGGTTCAGAATATCAAAC
CTTAGGTTATTTTTCTTTACACATTAAATACACTTATATTTTGAAGAACC
TATTTGGTCCTTGAATTATATAACTTAAATTTGCAATTGGAGGGAGTAAA
AAATTATAACATCTTAATCCTGTTAGGCCTATGATTGGCAGAGCAGAGGT
ATTCCTTTGCTTTGGACCTAGATTCTGCATGTCGTCACTTTGAGAAGCCA
TCAAGGTTGACAGTAATTTGTGCGCGTTGTGTTTAACATGTGTAGAGAAG
CAGTAATCCAAGAGCATGAACAGAAGATCAATAGATATCAAGCAATCCTT
GCAGCCCGTCTGAAGGCCAAGTTTTTCTCTAAAAAGGCTTTTGACAGAGG
TACTCATGCACTCTTCAACCTCTTGAACTTTCTAGAGTCACCTAATTTCT
AGTGTATGCCATTTTTCTCTTTGTTCTATCGCAGACAATCTGATCATTTT
GTCTGGCTGTAGCAGCTCTGCCGTTGAGTGAAAATGTGTTATACTTTTCT
CTAATATATTTTGAGTACATTATCAGCGAAAGTTAGGGTGGCACCGTTCA
TATTGTTTTTGACGGAATTCATGACTCAAGCTCTCTCACATATCAGTCAG
AATATGTTAGTCTAGGACATAACTCTGTTACAAATGAGTACTCCTTAAAC
CTAATAATCATAGTTCTAATTTAATAGCGGTAATTATGTAAGTCTAGGGT
CTGTTTGAGCTTACCTGAATTAGAATGTCAGTCAATTTAAGATCATCACA
ACTCTTTTCAGATGCTAAACTGGAAAATGGGCTTTTCCCTTTTCAGTGTC
AGCTCAAGCTAGCCTTAGATTTGTTATTTGGCTGCCTGATAATAAAGAAC
TAATAACTTGCTAATGCATCTTCCTCTGCTAGTCAGACAGGTATTAACAA
CTTAAGTGTCTGTTATATCTGATGTGTATGCTTAGAGCCAATTGCCACTT
CATATAGAAAAGTTACATCAAACAGGACCATGCAAATTATTTGTTAGTCA
GCATTGATTAGCATGATATATGGCTATCTTTTCTGTGTGAACCTTTTGTG
TTGATAAGTCATTTGATCAACATCTCTAAGCACTACAAATCTATGTTTAT
GGCCTTATGGGGGCTACTATTAGAAACTATGAACAATATGCATATATTTA
TGTTAACAGTTATCTAATGAGCTGCTATTTTCTTTTCTGAATTTCAATTT
ACTTTGCTGTCTTCCACTAGTGGACTCCTAGAGAAATGGGATTTTCTGAG
AAAGGGAAATGACGGTGAAAATGATTTTACTGGATGGATGTCACTAGGAT
GATTCTGCTAAATTTGCAGATGGTCCTTTTACATGTCAATGCTGGTCCAA
ATAGTCTAGAAGCCTCTGTAAATAACTGAAAACTGTGTATATTTCAACTG
TGATGTATTGTTAAATTTCTCTGTTGTGGTTGGTCACCAAGTAGTGGTAT
CAGCCAGACAGGGTTCAAATCCTGGCTTGCACCCAAAAAAACTTGCTCTG
CCTCCCCACAAAAAATAGCTGGGCACCAGCCTGCTGTAGTGGTGAGGTCC
TACCTGGAGTAGTGGCAGGGTTCGGGGTTTTCTTGGCCGGTTTGGCTGGG
GTTTCTTCTCATAGCAAAGCCGTGGGGGCAGTCCGGTTGAGTTTTTTTTT
AAAAAAATAAAAGTATCTCTGTTTATGAGGATTTATTTGTTACAGTTTCC
TTAATGGATGATTATTCTTCTTGTTTCACATGTGTTTTCTAGTCAACATT
CCCTGCATCTTGATGCAAAGTTTCATTTTGATTGATTAGAAGTTTAAAAA
AAGTACTAGCTCTCTTTTCTTAGACCTTATATAAATTTTCTGCTATTTGT
CCTGTTAATAGGGAACATCTTTGAATCAGAAACCATTGTTGGAGGTGAAA
CAATCCGGTCAAGCAGGTATATTTCCTGTGAGCTATCACTCTATCCCATC
TCAGATTTCAGTATAGCAACATCTAAATGTCTTTTTTCCCTATAGGTGGC
CATGTACAAGATCGTTTGCAAACCCAGAATTTTTTTCCCGCGACAAGAAC
AGCCATGAGAAGGGAAATTCTCCATCTTCAGCAGCAGATTCCTCTGCCAA
GAACAACTCTCCACCCTTGGCTGGTGAAGCCTCACCAAAAAATAATGCTA
GTGCTTTGGTCACAGAAAACAATCTAACACCTGGAAAGAGACAGCAATCC
AAGAAGAATTGACCTGATGGATTAATGTAGGATAATCAGGTTATGTTGTG
TTCCTCTGTAGCCTGAGGCTAGCAACCTGAAGTATACACCTAGCAGGAAA
GGCAAATTGACGCCAAAAATGTTTGTAACCTGCTCTAAATTCAGTTTGTT
GTACCTGTTTTAGAAAGCATCTGTAGCGAGGAATACTGTTGTTTACTTGG
TATTTAAATTGATGTATTATAGACTATCCCTATTGAACCATTGATTGGTT
GCTCAAATCTGAATCCCAAATTTTCTTTATTACTCTGAATTTCATTATTC
GATTTAATTTCTTTTTATGTCGGTGATACACTTGTGGATGAAAATACGAA
GCTAACTTTTTTCACATGGCAATTTATAACTCCAGAGAGCATGCTGATAG
TCTGCTATTGACACTTTATGGTAATTCTTTCGATTATCATTTTTTTCTCA
TCTCATTATTGTCCATATTCTTATATCTTTCTTTTAAAGCTCCATGGACA
GAACCCGAAGTATTCAAGGTTCAGAGTTGACAGCATCATAGCAGGTACAC
ACATTCTCATATATAGGTAAATGCATTTATACACACACACACACACACAC
ACACACACACACTTGCAAATGGACTTACAATGCTATCGAGAGCTGAATGT
TTGGAAATGCTTGTGCAGTAATTTATGGGAGGGTAAAATGTTCTTATCTA
CGGAATCATATTACTGAACTGTAAGCTGTTTCTATCTGAATGTTGGCTGT
CTATAGTACTTTCCGGTTCTTGTCCCATTGTATGGAAAGTTGCATC
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gene from alignment at Sh_001B06:85076..89321+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Sh_001B06_g000090 ID=Sh_001B06_g000090|Name=Sh_001B06_g000090|organism=R570 Sugarcane cultivar|type=gene|length=4246bp|location=Sequence derived from alignment at Sh_001B06:85076..89321+ (R570 Sugarcane cultivar)
ATGGCTTCCTCCCCGTGGCCGCGCACCGCCGGTGCCGCCCCCGTCCCGCC GCCAGAAGCAGCAGCAGCTGCTGCTACTGCCGCCGCCACCCCCGCCCCGA CGTCGGAGCAGCACCGGGTTAAGGTCCCCCCACAACCCCGTTTTTTATTC TCTCCCACGGTCGATGGCTCGTTTTCTCTGGCTCTTCAGGTCCAAGCTGA GCTCCTGACTGGTGCGTGCAGGAGGAAGGAAACGCTGCCGCCGCGGCTGT ACCGAAGCAGGAGGAGGAGGAGGCCAAGCCCCACTTGCCGCCGGACGATG ACTCGTAATTGCGATCCCCCTTGCCATGCGTCGCTTCTCTGTTACCGCAA TGCATGCTCTGTCCTTGCGTGATTCTCGATAGAAACGCTGCTTCACTTAC GGTTATATTGTTTTATGCGTGCACCCGTAGGACTATATGGGATCCGCGAA CACGCTGTTGTATACTTGTATAGCCGACGGAGGTAGATGTCTGATACTAG TGCATGGATGAGATGGGGCTGTTACCCTAATACTGGTTGGCCCGTAGCCC CGTAACAATGGATAGTATATTAATGTTATTATATACTCATATACGGATAT ACCAATAACAGGAGTACCTCATCAGTCACCACTTTTGTAGTTTTACCATG TGCACAAGGAGTGGTGGAGCCAGAACCAAAGCCCTGTCAGCTCAACAGCA CTGATATTCTGGACTTAATATATTTGTTTGTAAGCAAATTTTAGCAAAAG AGGTGCTACTTTGCAAAAACCTGTGGGGTCGATGTGGTTCCACTATGGAG CACATGCGAGTGCCTCTTCATCTTTGACGCGGTGTTAGGCATGCGAAGGG AACATGATTAGGCTATATGTTGTTGATAATCATGTAAAAATAGTGGCAAA AAGGAATCAAGTTAGTATATATTTTTTTTCAGAAAGTGCGTCAAGGTATA CCATTTGCACATCTTATTTCTCCTAATTTTCTGGTTCCAGCATATTAGTT CTCTCTGGAAGAAGAAGAAAAAGGATGACATCTGTTCTCTACTTAGTGAA AAACACACATAGGTTTCGTCCCTATACATTGATTCTTTGCATCTGTAATG TCACATCTTCTATCTTGTAGAGTTTTGGTCTCTCTATCAACAATGTATCC AAATCCCACGATTGACAAGCTGATCTGGACAATTTTGACTTTGTAGTAAG TTACACATTGAATTGTTTGACTAATTACCTTTTGGTTCAGAATATCAAAC CTTAGGTTATTTTTCTTTACACATTAAATACACTTATATTTTGAAGAACC TATTTGGTCCTTGAATTATATAACTTAAATTTGCAATTGGAGGGAGTAAA AAATTATAACATCTTAATCCTGTTAGGCCTATGATTGGCAGAGCAGAGGT ATTCCTTTGCTTTGGACCTAGATTCTGCATGTCGTCACTTTGAGAAGCCA TCAAGGTTGACAGTAATTTGTGCGCGTTGTGTTTAACATGTGTAGAGAAG CAGTAATCCAAGAGCATGAACAGAAGATCAATAGATATCAAGCAATCCTT GCAGCCCGTCTGAAGGCCAAGTTTTTCTCTAAAAAGGCTTTTGACAGAGG TACTCATGCACTCTTCAACCTCTTGAACTTTCTAGAGTCACCTAATTTCT AGTGTATGCCATTTTTCTCTTTGTTCTATCGCAGACAATCTGATCATTTT GTCTGGCTGTAGCAGCTCTGCCGTTGAGTGAAAATGTGTTATACTTTTCT CTAATATATTTTGAGTACATTATCAGCGAAAGTTAGGGTGGCACCGTTCA TATTGTTTTTGACGGAATTCATGACTCAAGCTCTCTCACATATCAGTCAG AATATGTTAGTCTAGGACATAACTCTGTTACAAATGAGTACTCCTTAAAC CTAATAATCATAGTTCTAATTTAATAGCGGTAATTATGTAAGTCTAGGGT CTGTTTGAGCTTACCTGAATTAGAATGTCAGTCAATTTAAGATCATCACA ACTCTTTTCAGATGCTAAACTGGAAAATGGGCTTTTCCCTTTTCAGTGTC AGCTCAAGCTAGCCTTAGATTTGTTATTTGGCTGCCTGATAATAAAGAAC TAATAACTTGCTAATGCATCTTCCTCTGCTAGTCAGACAGGTATTAACAA CTTAAGTGTCTGTTATATCTGATGTGTATGCTTAGAGCCAATTGCCACTT CATATAGAAAAGTTACATCAAACAGGACCATGCAAATTATTTGTTAGTCA GCATTGATTAGCATGATATATGGCTATCTTTTCTGTGTGAACCTTTTGTG TTGATAAGTCATTTGATCAACATCTCTAAGCACTACAAATCTATGTTTAT GGCCTTATGGGGGCTACTATTAGAAACTATGAACAATATGCATATATTTA TGTTAACAGTTATCTAATGAGCTGCTATTTTCTTTTCTGAATTTCAATTT ACTTTGCTGTCTTCCACTAGTGGACTCCTAGAGAAATGGGATTTTCTGAG AAAGGGAAATGACGGTGAAAATGATTTTACTGGATGGATGTCACTAGGAT GATTCTGCTAAATTTGCAGATGGTCCTTTTACATGTCAATGCTGGTCCAA ATAGTCTAGAAGCCTCTGTAAATAACTGAAAACTGTGTATATTTCAACTG TGATGTATTGTTAAATTTCTCTGTTGTGGTTGGTCACCAAGTAGTGGTAT CAGCCAGACAGGGTTCAAATCCTGGCTTGCACCCAAAAAAACTTGCTCTG CCTCCCCACAAAAAATAGCTGGGCACCAGCCTGCTGTAGTGGTGAGGTCC TACCTGGAGTAGTGGCAGGGTTCGGGGTTTTCTTGGCCGGTTTGGCTGGG GTTTCTTCTCATAGCAAAGCCGTGGGGGCAGTCCGGTTGAGTTTTTTTTT AAAAAAATAAAAGTATCTCTGTTTATGAGGATTTATTTGTTACAGTTTCC TTAATGGATGATTATTCTTCTTGTTTCACATGTGTTTTCTAGTCAACATT CCCTGCATCTTGATGCAAAGTTTCATTTTGATTGATTAGAAGTTTAAAAA AAGTACTAGCTCTCTTTTCTTAGACCTTATATAAATTTTCTGCTATTTGT CCTGTTAATAGGGAACATCTTTGAATCAGAAACCATTGTTGGAGGTGAAA CAATCCGGTCAAGCAGGTATATTTCCTGTGAGCTATCACTCTATCCCATC TCAGATTTCAGTATAGCAACATCTAAATGTCTTTTTTCCCTATAGGTGGC CATGTACAAGATCGTTTGCAAACCCAGAATTTTTTTCCCGCGACAAGAAC AGCCATGAGAAGGGAAATTCTCCATCTTCAGCAGCAGATTCCTCTGCCAA GAACAACTCTCCACCCTTGGCTGGTGAAGCCTCACCAAAAAATAATGCTA GTGCTTTGGTCACAGAAAACAATCTAACACCTGGAAAGAGACAGCAATCC AAGAAGAATTGACCTGATGGATTAATGTAGGATAATCAGGTTATGTTGTG TTCCTCTGTAGCCTGAGGCTAGCAACCTGAAGTATACACCTAGCAGGAAA GGCAAATTGACGCCAAAAATGTTTGTAACCTGCTCTAAATTCAGTTTGTT GTACCTGTTTTAGAAAGCATCTGTAGCGAGGAATACTGTTGTTTACTTGG TATTTAAATTGATGTATTATAGACTATCCCTATTGAACCATTGATTGGTT GCTCAAATCTGAATCCCAAATTTTCTTTATTACTCTGAATTTCATTATTC GATTTAATTTCTTTTTATGTCGGTGATACACTTGTGGATGAAAATACGAA GCTAACTTTTTTCACATGGCAATTTATAACTCCAGAGAGCATGCTGATAG TCTGCTATTGACACTTTATGGTAATTCTTTCGATTATCATTTTTTTCTCA TCTCATTATTGTCCATATTCTTATATCTTTCTTTTAAAGCTCCATGGACA GAACCCGAAGTATTCAAGGTTCAGAGTTGACAGCATCATAGCAGGTACAC ACATTCTCATATATAGGTAAATGCATTTATACACACACACACACACACAC ACACACACACACTTGCAAATGGACTTACAATGCTATCGAGAGCTGAATGT TTGGAAATGCTTGTGCAGTAATTTATGGGAGGGTAAAATGTTCTTATCTA CGGAATCATATTACTGAACTGTAAGCTGTTTCTATCTGAATGTTGGCTGT CTATAGTACTTTCCGGTTCTTGTCCCATTGTATGGAAAGTTGCATC
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